本指南的內容涵蓋了河流生態(tài)環(huán)境調查與問題診斷，河流生態(tài)修復總體設計，河道形態(tài)保持、基底及岸坡修復，河道緩沖帶構建，河道生態(tài)多樣性修復，河道水質凈化等方面，以及相關工程項目的維護與管理、投資估算方法等。本指南有助于指導各地開展入湖河流生態(tài)環(huán)境保護工作，改善入湖河流生境，提高河道自凈能力，為維護湖泊及流域生態(tài)系統健康提供保障。
本指南適用于江河湖泊流域中小型河流河道的生態(tài)建設與修復工作。中小型河流原則上是指流域面積在200～3000km2 的河流，同時可兼顧一些流域面積小于200 km2 的小型河流。