一旦建設(shè)工程被人民法院或建設(shè)行政主管部門認(rèn)定為工程轉(zhuǎn)包，就必然會產(chǎn)生一系列糾紛的發(fā)生，那么掌握如何來處理這一系列糾紛就顯得尤為必要了。
1.工程轉(zhuǎn)包合同效力的認(rèn)定及處理原則
《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》規(guī)定，工程轉(zhuǎn)包人和被轉(zhuǎn)包人之間簽訂的建設(shè)工程施工合同無效，人民法院在認(rèn)定施工合同無效時，可以同時依法收繳當(dāng)事人已經(jīng)取得的非法所得。
2.承包人與發(fā)包人之間糾紛的處理
承包人與發(fā)包人一旦簽訂了建設(shè)工程施工合同，承包人就應(yīng)當(dāng)按照合同約定全面履行合同義務(wù)。如果承包人非法轉(zhuǎn)包工程項目，從施工合同主體的相對性角度來看，承包人就構(gòu)成對施工合同的實質(zhì)性違約，發(fā)包人當(dāng)然可以根據(jù)施工合同的約定追究承包人的違約責(zé)任并可以依法解除與承包人簽訂的施工合同。因承包人的非法轉(zhuǎn)包工程行為，造成工期延誤及出現(xiàn)工程質(zhì)量問題的，發(fā)包人還可以向承包人提出賠償要求。
如果承包人是采取掛靠方式非法轉(zhuǎn)包工程的，出借資質(zhì)的被掛靠施工企業(yè)與建設(shè)單位所簽訂的施工合同無效。掛靠人與被掛靠人對建設(shè)單位因此而造成的損失承擔(dān)連帶賠償責(zé)任。如果建設(shè)單位在知情的情況下，仍然與被掛靠的施工企業(yè)簽訂施工合同的，則建設(shè)單位對該轉(zhuǎn)包行為也有過錯，建設(shè)單位應(yīng)當(dāng)承擔(dān)相應(yīng)的過錯責(zé)任。
當(dāng)承包人非法轉(zhuǎn)包工程被依法認(rèn)定為無效后，承包人與發(fā)包人之間就不可避免的會產(chǎn)生工程款就算糾紛。根據(jù)《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》第二條、第三條的相關(guān)規(guī)定，工程款如何結(jié)算取決于工程是否竣工驗收合格。建設(shè)工程施工合同無效，但建設(shè)工程經(jīng)竣工驗收合格，承包人可以請求參照合同約定支付工程價款。建設(shè)工程施工合同無效，且建設(shè)工程經(jīng)竣工驗收不合格的，按照以下情形分別處理：修復(fù)后的建設(shè)工程經(jīng)竣工驗收合格，發(fā)包人請求承包人承擔(dān)修復(fù)費用的，應(yīng)予支持;修復(fù)后的建設(shè)工程經(jīng)竣工驗收不合格，承包人請求支付工程價款的，不予支持。因建設(shè)工程不合格造成的損失，發(fā)包人有過錯的，也應(yīng)承擔(dān)相應(yīng)的民事責(zé)任。
3.工程轉(zhuǎn)包人與被轉(zhuǎn)包人之間糾紛的處理
轉(zhuǎn)包人與被轉(zhuǎn)包人之間簽訂的施工合同依法被認(rèn)定為無效后，轉(zhuǎn)包人與被轉(zhuǎn)包人不可避免的會產(chǎn)生一定的經(jīng)濟(jì)損失。對于經(jīng)濟(jì)損失，應(yīng)根據(jù)雙方當(dāng)事人(即轉(zhuǎn)包人與被轉(zhuǎn)包人)的過錯程度和責(zé)任大小，確定他們應(yīng)當(dāng)承擔(dān)的賠償數(shù)額。因無效合同造成的損失范圍，一般包括誤工費、停工費、保管費、機(jī)械設(shè)施閑置費、租賃費、臨時設(shè)施建造費等直接與該工程有關(guān)而獨立發(fā)生的費用等。
4.工程轉(zhuǎn)包糾紛訴訟當(dāng)事人的確定
一項工程被認(rèn)定為工程轉(zhuǎn)包而產(chǎn)生一系列糾紛時，訴訟中如何確定各當(dāng)事人的訴訟地位對于訴訟成敗尤為關(guān)鍵。如果分包人對工程轉(zhuǎn)包合同糾紛提起訴訟，應(yīng)列轉(zhuǎn)包人和被轉(zhuǎn)包人作為共同被告;如果是轉(zhuǎn)包人與被轉(zhuǎn)包人之間的合同糾紛，則以轉(zhuǎn)包人和被轉(zhuǎn)包人為訴訟主體，建設(shè)單位列為第三人;如果是發(fā)生多次轉(zhuǎn)包的，則列直接產(chǎn)生糾紛的當(dāng)事人為訴訟主體，將其他各方列為第三人。
如果承包人是采取掛靠方式非法轉(zhuǎn)包的，承包人與建設(shè)單位發(fā)生的糾紛起訴到法院的，一般應(yīng)以掛靠施工單位和被掛靠施工單位作為共同訴訟人，起訴或應(yīng)訴。如果施工單位掛靠其他建筑施工企業(yè)，并以被掛靠施工企業(yè)名義簽訂施工合同的，被掛靠建筑施工企業(yè)不愿起訴的，施工單位可作為原告起訴，不必將被掛靠建筑施工企業(yè)列為共同原告。
